... 2024-12-09 03:20 .. 苹果中超过30%的品种是通过芽变选种培育而来。
一直以来,常规的遗传变异检测基于单个参考基因组,在序列比对时会产生参考基因组偏好性,影响变异检测的准确度。
特别是对苹果等高杂合度物种,传统检测方法所获得的变异大多是在不同芽变品种中共有的杂合胚系变异,真正导致芽变品种具备不同特点的体细胞变异往往被掩盖在其中。
针对这一问题,研究团队使用长读长测序数据、家系数据和Hi-C(高通量染色体构象捕获)数据,构建了一套完全定相的高质量二倍体基因组,并由此开发了一套体细胞变异检测流程,将基因组测序数据比对到最优的单倍体基因组上,从而降低了变异检测过程中的假阳性,成功排除掉了品种间共享的杂合胚系变异的干扰,为后续分析提供了重要基础。
果蔬园艺作物种质创新与利用全国重点实验室主任、华中农业大学教授徐强认为,该检测流程精确区分了体细胞变异与杂合变异,不仅能够服务于苹果遗传改良,还为果树 .. UfqiNews ↓
1
本页Url
🤖 智能推荐